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CapitalBio miRNA 芯片检测

检测原理| 技术优势| 应用案例| 产品列表| 数据分析|

 

 

  • 通过聚类、SAM等数据分析,可以比较不同组织中miRNA表达的差异情况;
  • 芯片miRNA的检测较传统的Northern Blot分析通量高,而且敏感性和特异性均较高;
  • 拥有一套先进的芯片实验质控体系,对芯片制作及实验全过程实施严格的质控,保证实验结果的准确、可靠;
  • 晶芯 miRNA芯片服务平台是由博奥生物自主研究开发,对整个平台的技术细节及国际进展有很强的把握能力,在提供技术服务的同时还可以给予客户更深层次的建议;目前利用该平台的服务结果撰写的文章已经发表在PNAS,Cancer Research,Oncogene,RNA等专业领域重点杂志上。

研究者使用miRNA芯片检测31对原发性食管癌和癌旁组织样品的miRNA表达情况,通过PCA-SVM算法寻找表达模式分类器(包含7个miRNA分 子),从而通过表达数据对癌和癌旁组织进行有效区分。通过Kaplan-Meier生存分析发现hsa-miR-103/107的低表达水平与食管癌病人的生存率高度相关。文献来源: Guo, Y., et al., Cancer Research, 2008, 68(1):1-8

图1.用Cluster3.0软件对31对食管癌/癌旁组织样本进行非监督聚类。C表示癌组织,P表示癌旁正常组织。除6个样本(用“#”标记)被错误分类外,其他所有癌及癌旁正常组织均被正确区分。
图2. Hsa-miR-103/107的表达水平与食管癌病人生存期具有密切关系(A.训练样本集;B.测试样本集)

产品编号
服务名称
产品描述
225014
晶芯 哺乳动物miRNA微阵列芯片服务V4.0
针对人988(包含预测的122个,Nature2005434338-345)、小鼠 627 个、大鼠 350 个成熟的miRNA,取三者的并集,去除冗余后一共设计了 1320 条探针(数据来自Sanger 的数据库:miRBase 12.0)
225111
晶芯 植物miRNA微阵列芯片服务V2.0
Sanger数据库中20072月植物全部的994条序列,去除冗余后得到348miRNA和朱健康(Zhu Jian- Kang)等上预测的 4(Cell20051231279-1291),中科院遗传与发育所预测的74个,芯片上一共有426miRNA 对应的探针。包括拟南芥、水稻等多个物种。

miRNA芯片数据分析部分结果展示如下:

 

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