生物信息学

CNV与表达谱数据的整合分析

利用Partek软件对CNV数据与表达谱数据进行整合分析,包括CNV-mRNA、CNV-miRNA、CNV-lncRNA和CNV-exon四个方面的内容。

1 CNV与基因表达的数据整合

对于CNV数据,首先要得到在多个样品间重复出现的CNV区域,接下来与差异基因的表达数据合并。CNV与基因表达

2 CNV与基因表达的相关分析

计算发生于多个样本或单一样本CNV区域的CN与相应基因表达水平的相关性。

CNV区域中CN与基因表达的相关分析图

CNV区域中CN与基因表达的相关分析图

参考文献 

1. Partek Tutorial and Data Repository. http://wwwpartekcom/Tutorials/.