生物信息学

甲基化数据与基因表达数据整合分析

1.基因的甲基化和表达水平相关分析

利用甲基化数据与mRNA表达数据,将甲基化差异水平与表达差异水平的数据进行整合,计算两者的相关性以及差异甲基化在样品中的发生频率。

图片2

       横坐标代表相关系数,纵坐标为在相应的系数区间的频数。

 DNA甲基化和基因表达相关分析图

 

2. 甲基化水平改变与表达水平改变基因的统计

统计疾病与正常等不同实验分组间,启动子区差异甲基化基因与差异表达基因的四种分布情况。

启动子区甲基化差异与基因表达差异的分布图

启动子区甲基化差异与基因表达差异的分布图(引自:Fan M,et al。Cancer Res ,2006