生物信息学Biological

候选区域的关联研究

候选区域的关联研究主要是指在前期GWAS或其他相关研究基础上,针对靶标区域的研究。博奥生物提供的候选区域关联分析服务主要包括:

  • 研究设计相关的咨询服务;
  • 挑选tagSNP:基于全基因组数据或HapMap等公共数据挑选tagSNP;
  • 位点质控:根据MAF(Minor Allele Frequency)、HWE(Hardy-Wenberg Equilibrium)检验结果等指标对SNP位点进行预处理; 

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  • 单点关联分析:对定性表型或定量性状,采用Allelic、Genotypic、Dominant、Recessive等多种遗传模型进行关联检验,必要时考虑年龄、性别等协变量;
  • 多点分析:基于多个SNP的回归分析、单体型分析和基因环境交互分析等;

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  • 显著位点注释:用MAS软件对显著位点进行功能注释;